此版《源氏物語 千年之謎》由鶴橋康夫執導，不僅使用CG，還加入動作場面和科幻效果，制作費用高達十億多日元(折合人民幣7千8百多萬)，於2011年12月10日在日本全國公映。

影片把原著作者紫式部(中谷美紀 飾)身處的平安時期與光源氏（生田鬥真 飾）所在天下相交錯，兩條線 索並行。壹個空間中紫式部受藤原道長（東山紀之 飾）任命開始創作《源氏物語》，並與藤原道長發生了愛情牽絆。另壹個空間是紫式部創作出的光源氏與藤壺女禦（真木陽子 飾）、六條禦息所（田中麗奈 飾）、夕顏（蘆名星 飾）等眾多女性的愛情糾葛。在關閉的創作進程中，紫式部現出了靈魂出竅的狀態，與筆下對光源氏陷入苦戀而化為生靈的六條禦息所的靈魂重疊。陰陽師安倍晴明（窪冢洋介 飾）發現了這個情況，開始追蹤生靈……